Участник Великой Отечественной войны. Командовал орудийным расчетом, в августе 1941 года был тяжело ранен. В 1942-1947 гг. учился в Военно-морской медицинской академии. В 1950 г. защитил кандидатскую, в 1963 году –докторскую диссертацию. Профессор. Начальник кафедры терапии. С 1972 года – Главный терапевт МО СССР, с 1977 по 1989 год – начальник Центрального медицинского управления Министерства обороны СССР.
Ф.И. Комаров - один из выдающихся русских ученых, внесших большой вклад в развитие отечественной медицины. Автор свыше 350 научных работ, в их числе учебники, монографии по различным проблемам внутренней медицины. Им подготовлено 85 докторов, кандидатов медицинских наук.
За большие заслуги в развитии отечественной медицины, постоянную заботу об охране здоровья воинов Смоленского гарнизона, большую помощь в подготовке местных медицинских кадров Ф.И. Комарову в мае 1985 года присвоено звание "Почетный гражданин горда - героя Смоленска".