Прохоров Владимир Николаевич родился 4 августа 1947 года в городе Ярцево Смоленской области. С 1966 года он работал на Ярцевском хлопчатобумажном комбинате. Впоследствии находился на советских и партийных должностях. В течение пяти лет Прохоров был первым секретарём Демидовского райкома КПСС. В 1988-1991 годах он занимал должность председателя исполкома Смоленского горсовета народных депутатов, в 1991-1993 годах был первым заместитем мэра Смоленска.
Одновременно с 1990 года Владимир Николаевич являлся руководителем Смоленского областного отделения Российской транспортной инспекции - главным государственным транспортным инспектором. В 1993-1997 годах он был заместителем, затем первым заместителем главы администрации Смоленской области Анатолия Глушенкова. Когда губернатором Смоленской области стал Александр Прохоров, Владимир Прохоров был снят с последнего поста. В мае 2002 года Прохоров был назначен первым заместителем главы администрации Смоленской области Виктора Маслова. Незадолго до этого своего назначения Прохоров возглавлял предвыборный штаб Маслова.
В мае-августе 2002 года Прохоров вёл большую работу в Администрации Смоленсrой области. В его ведении в тот период находились кадровые вопросы, распределение заказов на строительство трубопровода «Ямал-Европа», проходивший через Смоленскую область, а также ряд других ключевых вопросов. При Прохорове в администрацию Смоленской области стали возвращаться его старые соратники, с которыми он работал ещё при Глушенкове.
7 августа 2002 года Прохоров был застрелен у своего дома № 21 по улице 3-я линия Красноармейской слободы. Когда утром он вышел с супругой из дома и направился пешком на работу, приблизительно в 50 метрах от подъезда из кустов по нему открыл огонь неизвестный. Убийца сделал пять (по другим данным - шесть) выстрелов, три из них попали в цель. От полученных ранений Прохоров скончался на месте. Находившаяся с ним его жена не пострадала. Впоследствии она рассказала, что видела, как из кустов выбежал мужчина, который выстрелил, а затем скрылся за расположенными неподалёку домами.
Убийство так и не было раскрыто. Губернатор Смоленской области Виктор Маслов заявил, что убийство Прохорова - следствие победы его блока на выборах в мае 2002 года.
По предположениям «Газеты.Ру», к нему могла иметь отношение организованная преступная группировка, возглавляемая Алексеем Конаревым, которая в то время активно участвовала в криминальном переделе Смоленска.
Владимир Николаевич похоронен на Братском кладбище Смоленска.
За особые заслуги в развитии экономики, социальной сферы, жилищно-коммунального хозяйства и системы общественного транспорта города Смоленска 52 сессия Смоленского городского Совета IV созыва своим решением № 913 от 27 августа 2013 года присвоила Владимиру Николаевичу Прохорову звание «Почетный гражданин города-героя Смоленска» (посмертно)